日本海的水域有6个海峡与外水域相通，分别为：间宫海峡、宗谷海峡、津轻海峡、关门海峡、对马海峡还有朝鲜海峡(大韩海峡)。
港口
日本海沿岸海岸线过于平直，多悬崖峭壁，港口稀少，良港不多。沿岸重要港市有符拉迪沃斯托克(海参崴)、元山、釜山、北九州、下关、新潟(日)等。
地质
日本海海域呈不规则菱形，东北窄，中、南部宽，从西南向东北延伸2200多公里，东西宽约900公里，最大宽度1265公里，平均深度1350米，最深处4036米。面积约106万平方公里。
大陆架面积28.4万平方公里，约占海域面积1/4。大陆坡分500～1000米和2000～3000米两个海底斜面。海盆大
日本海地理位置
部深达3000米（3000米以上的约达30万平方公里）。形成于新第三纪初期至中期。北纬44°以北地区海水较浅，有一条南北向狭长的鞑靼海槽。北纬40°～45°之间，海底平坦，水深3000米以上，为日本海盐。北纬40°以南，海底地形复杂，有海岭、海盆、海槽、海台和海底谷等。海峡一般都狭而浅，其最窄处和最浅处的宽度和深度分别为：鞑靼海峡7.3公里和7米；43公里和50米；18.5公里和130米；对马海峡41.6公里和50米。
日本海海底以海盆和峡谷为主。日本海海底有一条日本海沟，它位于日本群岛东部深邃的海底洼地。该海沟深度很大，其北部的塔斯卡罗拉海渊最深处达8513米，曾经被认为是世界海洋的最深点。
日本海的陆架较短，且发育得很不好。沿日本西岸，大陆架到200米水深止，朝鲜和苏联东岸，大陆架到140米水深止。这些大陆架都被许多海底峡谷所切割。西部边缘，峡后的口端伸到2000米深度附近；东部边缘，峡谷口端伸到800米深度附近。
日本海最大的岛在我家，水深均大于3000米，无甚特色的海盆，称为日本海盆。从该海盆往南就较复杂，海底被大和堆和修普浅滩隔开，两浅滩之间又隔着一条深海槽。南部的海底还局部地分布着一些岛屿，如朝鲜海峡(大韩海峡)有对马群岛，本州南部西岸有隐歧群岛，韩国近岸有郁陵岛。